Новости

Опубликована статья «Alternative splicing shapes transcriptome but not proteome diversity in Physcomitrella patens».

В журнале Scientific Reports вышла наша статья, посвященная анализу альтернативного сплайсинга у модельного организма, мха Physcomitrella patens с использованием транскриптомного и протеомного профилирования.

Предстоящие конференции по биоинформатике

1.     23-24 октября 2018, Next Generation Sequencing and Biostatistics,  Дубай, ОАЭ

 

2.     13-14 ноября 2017, 9-ая международная конференция по биоинформатике, Bioinformatics, Париж, Франция.

 

3.     16-18 мая  2018, 11-я международная конференция Metabolomics & Systems Biology. Токио, Япония.

 

Бактерии кишечной микробиоты могут приостановить действие противоопухолевых препаратов

 На сегодняшний день появляется все больше свидетельств в пользу того, что микробиом, состав которого уникален у каждого человека, может иметь ключевое значение для определения того сработает ли данный препарат для данной конкретной персоны.

Опубликована статья "Agent Based Modeling of Human Gut Microbiome Interactions and Perturbations"

В журнале PLoS ONE вышла наша статья, посвященная моделированию межвидовых метаболических связей, в том числе под влиянием антибиотикотерапии, с помощью агентной модели микробного сообщества кишечника человека.

Опубликована статья "Assessment of k-mer spectrum applicability for metagenomic dissimilarity analysis"

В журнале BMC Bioinformatics вышла наша статья, посвященная безреференсному анализу состава метагеномов на основании анализа спектра частот k-меров.

Dubinkina, V. B., Ischenko, D. S., Ulyantsev, V. I., Tyakht, A. V., & Alexeev, D. G. (2016). Assessment of k-mer spectrum applicability for metagenomic dissimilarity analysis. BMC bioinformatics, 17(1), 1.

https://bmcbioinformatics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12859-015-...

 

В журнале Endocrine Connections вышла наша совместная публикация

Государственный научно-исследовательский центр профилактической медицины совместно с НИИ ФХМ ФМБА России, российским геронтологическим научно-клиническим центром и МФТИ сделали совместную публиацию под названием "Gut microbiota and diet in patients with different glucose tolerance ", которая недавно была опубликована в журнале Endocrine Connections.

Современное состояние проблемы антибиотикорезистентности

В статье высказывается мнение экспертов на доклад О'Нилла о необходимости многомиллиардных инвестиций для борьбы с антибиоткорезистнтными штаммами. В качестве одного из экспертов выступает участник консорциума metagenome.ru Алексеев Дмитрий Глебович. Более подробно с материалом можно ознакомиться по ссылке:

Наш проект по механизмам антибиотикорезистентности был поддержан РНФ

Российский научный фонд поддержал наш инициативный проект по изучению вариабельности резистома микробиоты кишечника у жителей РФ для обнаружения путей передачи и распространения антибиоткорезистентности.

Заканчивается 2-й этап работ по соглашениям о предоставлении субсидий с Минобрнауки России

За 2-й этап была пополнена коллекция образцов микробиоты кишечника пациентов с воспалительными заболеваниями кишечника, пациентов с  хеликобактерной инфекцией и пациентов с алкоголизмом. В настоящее время производится секвенирование собранных образцов, ожидаем результаты! 

Еще один проект Сибирского Государственного Медицинского Университета поддержан Минобрнауки

Минобрнауки поддержал финансирование проекта по исследованию болезни Паркинсона под названием "Выявление биомаркеров микробиотического сообщества кишечника для ранней, доклинической диагностики болезни Паркинсона".